RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDAP1Q8TB36 358 aa17.88■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIS12Q9H081 205 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCX3BQ9H321 246 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.87■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA6P17066 643 aa17.85■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALS2CLQ60I27 953 aa17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF1AQ12756 1690 aa17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANO9A1A5B4 782 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF18P17022 549 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM270Q6UE05 265 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRX4P78413 519 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LXNQ9BS40 222 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF146Q9NTX7 359 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC188H7C350 402 aa17.83■□□□□ 0.44
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