RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 GPR153Q6NV75 609 aa26.03■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.03■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.03■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 MED24O75448 989 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 NPEPPSP55786 919 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 IL17AQ16552 155 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 XKR9Q5GH70 373 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 KRT79Q5XKE5 535 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM150BA6NC51 233 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 CLCN3P51790 818 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 LPIN1Q14693 890 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 TCP11Q8WWU5 503 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SLC9A7Q96T83 725 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 AKT3Q9Y243 479 aa26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 GPR32O75388 356 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 DGAT1O75907 488 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 RARRES1P49788 294 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 LRRC71Q8N4P6 559 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SNX29Q8TEQ0 813 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 GHRP10912 638 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 KCNJ6P48051 423 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 PTPAQ15257 358 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 HYIQ5T013 277 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ATL3Q6DD88 541 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF410Q86VK4 478 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ZBBXA8MT70 800 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ASAP2O43150 1006 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 F13A1P00488 732 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 VTNP04004 478 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ZBTB39O15060 712 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 GPC3P51654 580 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 EMC2Q15006 297 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 POTEGQ6S5H5 508 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 MTRQ99707 1265 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 CLIC4Q9Y696 253 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 GPR182O15218 404 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SLC39A14Q15043 492 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 KIZQ2M2Z5 673 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 USP28Q96RU2 1077 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 RPS6KA5O75582 802 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 PAK2Q13177 524 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 TCTN1Q2MV58 587 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 PADI3Q9ULW8 664 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 DNM3Q9UQ16 869 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 AMHP03971 560 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 POU5F1BQ06416 359 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 DRP2Q13474 957 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 RAB30Q15771 203 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 ECM1Q16610 540 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 OSMRQ99650 979 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-205ENST00000466861 GINS2Q9Y248 185 aa25.94■■□□□ 1.74
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