RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379378.7

E2F4-201, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F4, Length 2,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-201ENST00000379378 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 RAPGEF1Q13905 1077 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 HS2ST1Q7LGA3 356 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 RABGGTAQ92696 567 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 MKNK1Q9BUB5 465 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 TEX13BQ9BXU2 312 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 AIPL1Q9NZN9 384 aa30.11■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 WDR64B1ANS9 1081 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 CLCN6P51797 869 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 DLK2Q6UY11 383 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 GPRASP2Q96D09 838 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SH2D3AQ9BRG2 576 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 USO1O60763 962 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SFNP31947 248 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 ZNF446Q9NWS9 450 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 K7ENM7 598 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 PSMC5P62195 406 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 CYP39A1Q9NYL5 469 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 BACH1O14867 736 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 UCHL3P15374 230 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SH3D19Q5HYK7 790 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 ACAD9Q9H845 621 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 RGS20O76081 388 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 MAPTP10636 758 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 MAGEA1P43355 309 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 PLS1Q14651 629 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 GBP6Q6ZN66 633 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 FAM133AQ8N9E0 248 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 SIX2Q9NPC8 291 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 FHOD1Q9Y613 1164 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F4-201ENST00000379378 PJA2O43164 708 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 CYP2J2P51589 502 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 VGLL4Q14135 290 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 HOXC10Q9NYD6 342 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 MYPNQ86TC9 1320 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PLS3P13797 630 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 NLRX1Q86UT6 975 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 GOLGA5Q8TBA6 731 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ARID5AQ03989 594 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ASIC2Q16515 512 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 SLC9A9Q8IVB4 645 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.43e-7■■■■□ 24.9
E2F4-201ENST00000379378 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 GCNT4Q9P109 453 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 MAFGO15525 162 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 KCNA2P16389 499 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PLA2G4FQ68DD2 849 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 SYCP3Q8IZU3 236 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 RDM1Q8NG50 284 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ANO9A1A5B4 782 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 SPDYE4A6NLX3 237 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ANKEF1Q9NU02 776 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 FBXL5Q9UKA1 691 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 SAR1BQ9Y6B6 198 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 NPEPPSP55786 919 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 KLHL30Q0D2K2 578 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ALCAMQ13740 583 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 GPRC5CQ9NQ84 441 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 LCTP09848 1927 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 TRIM58Q8NG06 486 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 TIPINQ9BVW5 301 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PARD6BQ9BYG5 372 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F4-201ENST00000379378 PTPRFP10586 1907 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms