RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	URA4	P20051	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YAL037W	P39728	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GAT1	P43574	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	BIO3	P50277	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ASI2	P53895	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NUP53	Q03790	475 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FDH1	Q08911	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MMT2	Q08970	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	BET3	P36149	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	IST2	P38250	946 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RTC2	P38279	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PEX18	P38855	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SWP82	P43554	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MUP1	P50276	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GLO2	Q05584	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SOG2	Q08817	791 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YAK1	P14680	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MNL1	P38888	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FMC1	P40491	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GPI11	Q06636	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PFA4	Q12006	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SWI5	P08153	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ORC2	P32833	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YAR028W	P39548	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MSS2	P40990	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SSU1	P41930	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AAD14	P42884	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	LYS5	P50113	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PPT1	P53043	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MHT1	Q12525	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SNF4	P12904	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SRB5	P32585	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MTC2	P34246	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DDI1	P40087	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FAU1	P40099	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GAB1	P41733	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MDJ2	P42834	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CIN2	P46670	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HOC1	P47124	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YJR115W	P47152	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	VOA1	P53262	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RHO4	Q00246	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DBF2	P22204	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NPR1	P22211	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SPO23	P33757	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RRN5	Q02983	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RCN2	Q12044	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	BAG7	Q12128	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RKM5	Q12367	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SFA1	P32771	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YGR149W	P48236	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TLG1	Q03322	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HPF1	Q05164	967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
PDR10	YOR328W	FET3	P38993	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AIM25	P47140	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ARP10	Q04549	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CDA1	Q06702	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MTR10	Q99189	972 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SPT3	P06844	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
PDR10	YOR328W	KSS1	P14681	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	BUB3	P26449	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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