RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MGR1P25573 417 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MEI5P32489 222 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TOA1P32773 286 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COX13P32799 129 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07not detected
GCN4YEL009C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UTH1P36135 365 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MRPL37P36532 105 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PIM1P36775 1133 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ARA1P38115 344 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07 RIP-Chip
GCN4YEL009C YBR071WP38243 211 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RFC3P38629 340 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C INM1P38710 295 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MRX1P40050 688 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NDE1P40215 560 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MET18P40469 1032 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GCD10P41814 478 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPG5P42933 373 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YJR030CP47101 745 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YJR120WP47157 116 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MDM34P53083 459 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SGF73P53165 657 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C REX2P54964 269 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GAS3Q03655 524 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FMN1Q03778 218 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C VHS1Q03785 461 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YML096WQ04489 525 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GLO2Q05584 274 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YDL121CQ07541 149 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ESA1Q08649 445 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ATG29Q12092 213 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YLR049CQ12110 428 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPR011CQ12251 326 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ATG34Q12292 412 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SUL2Q12325 893 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TMA17Q12513 150 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SRN2Q99176 213 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C VPS13Q07878 3144 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C KAR1P11927 433 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SGV1P23293 657 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C OCA4P25366 362 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GFD2P25370 566 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SFC1P33303 322 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PTC1P35182 281 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CAF4P36130 643 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YBL029WP38201 376 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BMT2P38278 337 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GGC1P38988 300 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.1□□□□□ -2.07not detected
GCN4YEL009C FRT2P39734 528 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CAB2P40506 365 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FET5P43561 622 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UBX6P47049 396 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NAS6P50086 228 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C USE1P53146 245 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GIP3Q03016 1276 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YET2Q04210 160 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RSF1Q05043 376 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FAR10Q06001 478 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YEH2Q07950 538 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HUA2Q12134 243 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YOR114WQ12219 294 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YDR262WQ12331 272 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RKM5Q12367 367 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MHT1Q12525 324 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YCL012CQ8J0M4 134 aa2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C DST1P07273 309 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GAL7P08431 366 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TYR1P20049 452 aa2.09□□□□□ -2.07
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