RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PIK3CDO00329 1044 aa24.94■■□□□ 1.58
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CAPNS1-205ENST00000588780 PLCB4Q15147 1175 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MCTP2Q6DN12 878 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 CASP10Q92851 521 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 HIDE1A8MVS5 230 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 FGFR1P11362 822 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT17Q04695 432 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 TROAPQ12815 778 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PCYT2Q99447 389 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 RGS18Q9NS28 235 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 LZTS1Q9Y250 596 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-205ENST00000588780 KCNC3Q14003 757 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 FLCNQ8NFG4 579 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SDF4Q9BRK5 362 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 POMKQ9H5K3 350 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO10Q9HD67 2058 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR182O15218 404 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ASGR2P07307 311 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PDE4AP27815 886 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 JADE2Q9NQC1 790 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MAFGO15525 162 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 KLRC1P26715 233 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF5BP33176 963 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PLCB3Q01970 1234 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ITIH3Q06033 890 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 UBE2SQ16763 222 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ABI1Q8IZP0 508 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF558Q96NG5 402 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 CWH43Q9H720 699 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 CACNA1AO00555 2505 aa24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-205ENST00000588780 WEE2P0C1S8 567 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MTHFRP42898 656 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 ACTR2P61160 394 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MYL10Q9BUA6 226 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 PPM1AP35813 382 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 PBX3P40426 434 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-205ENST00000588780 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 NCOA7Q8NI08 942 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-205ENST00000588780 BACH1O14867 736 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 CLCN5P51795 746 aa24.87■■□□□ 1.57
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPG21Q9NZD8 308 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXA2O43364 376 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 KIZQ2M2Z5 673 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC43Q8N309 656 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-205ENST00000588780 OSMRQ99650 979 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-205ENST00000588780 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 HBP1O60381 514 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP21A2P08686 494 aa24.84■■□□□ 1.57
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