RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 EDNRBP24530 442 aa31.4■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RARRES1P49788 294 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 VWA3BQ502W6 1294 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 RETREG2Q8NC44 543 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPN18Q99952 460 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKEF1Q9NU02 776 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYBP10242 640 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.39■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCP110O43303 1012 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PEX10O60683 326 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTN2Q02246 1040 aa31.38■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF720Q7Z2F6 126 aa31.37■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SYCP1Q15431 976 aa31.34■■■□□ 2.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM59Q8IWR1 403 aa31.34■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ABHD10Q9NUJ1 306 aa31.34■■■□□ 2.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNMA3Q9UL41 463 aa31.34■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ODR4Q5SWX8 454 aa31.32■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.32■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NR2F2P24468 414 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL13P26373 211 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ALCAMQ13740 583 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC40Q4G0X9 1142 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
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