RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRD-211ENST00000486161 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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PTPRD-211ENST00000486161 MIS12Q9H081 205 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC18Q9H819 358 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 POLD4Q9HCU8 107 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 HESX1Q9UBX0 185 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.02□□□□□ -0.97
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