RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 POU4F1Q01851 419 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 IKZF1Q13422 519 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ODF1Q14990 250 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 BRD3Q15059 726 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C4orf46Q504U0 113 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 LBX2Q6XYB7 198 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CPA6Q8N4T0 437 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF15Q9NS87 1388 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ESR1P03372 595 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FUT4P22083 530 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GAB4Q2WGN9 574 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST14Q8NCH0 376 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 USP33Q8TEY7 942 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 EEA1Q15075 1411 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXN1O15353 648 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA12O60330 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SOD2P04179 222 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PLS3P13797 630 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM27P14373 513 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CCND1P24385 295 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 LTBRP36941 435 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PAK1Q13153 545 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TXNRD1Q16881 649 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CMIPQ8IY22 773 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC8Q9BY41 377 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CABP5Q9NP86 173 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC1BQ9P126 229 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TGM5O43548 720 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ULK1O75385 1050 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GSNP06396 782 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ZP2Q05996 745 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FSTL1Q12841 308 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PLCL1Q15111 1095 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM240Q5SV17 173 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 IL31Q6EBC2 164 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 IPPKQ9H8X2 491 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OXSMQ9NWU1 459 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ALS2Q96Q42 1657 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 HFM1A2PYH4 1435 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF10O15013 1369 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC66A2RUB6 948 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 APPP05067 770 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms