RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2orf54Q08AI8 447 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM58Q8NG06 486 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYP2W1Q8TAV3 490 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JADE2Q9NQC1 790 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RIPK3Q9Y572 518 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 B4DLN1 442 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXCL11O14625 94 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLCG1P19174 1290 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCT5P48643 541 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPIL2Q13356 520 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLFN12Q8IYM2 578 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OPTNQ96CV9 577 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF146Q9NTX7 359 aa18.92■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRIN2DO15399 1336 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCNTO95613 3336 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SKOR1P84550 965 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ALS2CLQ60I27 953 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRRC15Q8TF66 581 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEF6Q9H4E7 631 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBX3O15119 743 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNFRSF8P28908 595 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MICALL1Q8N3F8 863 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CALML4Q96GE6 196 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERGIC2Q96RQ1 377 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.91■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP2A1O14983 1001 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TACC1O75410 805 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EMBQ6PCB8 327 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC30A10Q6XR72 485 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MSH4O15457 936 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERLIN2O94905 339 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPHB4P54760 987 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT79Q5XKE5 535 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NSMFQ6X4W1 530 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.89■□□□□ 0.62
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPTORQ8N122 1335 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BICDL2A1A5D9 508 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF263O14978 683 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCNE1P24864 410 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRB10Q13322 594 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLS1Q14651 629 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPA17Q15506 151 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAVIN3Q969G5 261 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM20AQ96MK3 541 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEP89Q96ST8 783 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUEDC2Q9H467 287 aa18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLSTN1O94985 981 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LCA5LO95447 670 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPP1R2P41236 205 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GNGT1P63211 74 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYP27A1Q02318 531 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEP55Q53EZ4 464 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PNMA5Q96PV4 448 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAT3P40763 770 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLK7P49862 253 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NNTQ13423 1086 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 P2RX5Q93086 422 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.88■□□□□ 0.61
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC42Q96M95 316 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms