RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	CDC21	P06785	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	HXT2	P23585	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YCL068C	P25593	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SUA5	P32579	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SPR1	P32603	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YSC83	P32792	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
YKR104W	YKR104W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	QDR3	P38227	689 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	INA22	P40576	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YNL050C	P53952	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	STD1	Q02794	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	FMP42	Q04991	504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	MDM30	Q05930	598 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	MDM36	Q06820	579 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	INM1	P38710	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PET100	P38958	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RCY1	P39531	840 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YNL181W	P53878	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PET117	Q02771	107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	APC4	Q04601	652 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SOR2	Q07786	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	NSE1	Q07913	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	APC1	P53886	1748 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	CHO1	P08456	276 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TYR1	P20049	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SPT10	P35208	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YMR262W	P38430	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	GAT2	P40209	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TOS3	P43637	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YGL260W	P53056	76 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YTP1	P53584	459 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PLP2	Q12017	286 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	FMP16	Q12497	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PRB1	P09232	635 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PEP5	P12868	1029 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	YPS1	P32329	569 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	MIA40	P36046	403 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	SCC4	P40090	624 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	LOH1	P47055	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RAD17	P48581	401 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	MRP51	Q02950	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	TAF12	Q03761	539 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	AAD15	Q08361	143 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RDR1	Q08904	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	PSK1	P31374	1356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RIM15	P43565	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR104W	YKR104W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	MGR1	P25573	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	PPZ1	P26570	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	BUD2	P33314	1104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	MSN2	P33748	704 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	RPC25	P35718	212 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	ROT2	P38138	954 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	RTC2	P38279	296 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	TAE1	P38340	232 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	YHR045W	P38775	560 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	YND1	P40009	630 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	SPG5	P42933	373 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	BNA6	P43619	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	PHO86	P46956	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	YNL260C	P53846	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	DSL1	P53847	754 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	ESBP6	P53918	673 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	SHR3	Q02774	210 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	HSP31	Q04432	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.4 ms