RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 LNPKQ9C0E8 428 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPC6Q9Y210 931 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 SQORQ9Y6N5 450 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 FGF18O76093 207 aa25.04■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 ATP9AO75110 1047 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 INSRRP14616 1297 aa25.03■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.03■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.03■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 GINS2Q9Y248 185 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 PRR23AA6NEV1 266 aa25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-205ENST00000588780 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 DENND3A2RUS2 1198 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 APOBRQ0VD83 1088 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-205ENST00000588780 HIP1O00291 1037 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNA2P16389 499 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT76Q01546 638 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 UBALD2Q8IYN6 164 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 S1PR5Q9H228 398 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 PLXNA3P51805 1871 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM186AA6NE01 2351 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-205ENST00000588780 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-205ENST00000588780 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-205ENST00000588780 ODR4Q5SWX8 454 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 TMC7Q7Z402 723 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-205ENST00000588780 ADSSL1Q8N142 457 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-205ENST00000588780 CDH22Q9UJ99 828 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-205ENST00000588780 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.94■■□□□ 1.58
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