RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MAFKO60675 156 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 F2P00734 622 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ITGB3P05106 788 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CNGA1P29973 690 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 DHCR24Q15392 516 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 FAM124AQ86V42 546 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 MROH6A6NGR9 719 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 MAN2B1O00754 1011 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 KRT15P19012 456 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 EPHA5P54756 1037 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 DSG1Q02413 1049 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CR1LQ2VPA4 569 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 LGI4Q8N135 537 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 MYOTQ9UBF9 498 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 INVSQ9Y283 1065 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 SLC27A2O14975 620 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 SCNN1BP51168 640 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 FIGNQ5HY92 759 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 BORAQ6PGQ7 559 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 KCTD1Q719H9 257 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NXPE1Q8N323 547 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 BOCQ9BWV1 1114 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CD244Q9BZW8 370 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZNF536O15090 1300 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 NACADO15069 1562 aa6.9□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SLC12A8A0AV02 714 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 EYA4O95677 639 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 BPIP17213 487 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ADAM9Q13443 819 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 PRR31Q5SQ13 230 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LOXL4Q96JB6 756 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SCRIBQ14160 1630 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 KCNK3O14649 394 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 GAS7O60861 476 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 PLATP00750 562 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 STRN3Q13033 797 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TUSC3Q13454 348 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 DTLQ9NZJ0 730 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CROTQ9UKG9 612 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LTFP02788 710 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 IL13P35225 146 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ADAM17P78536 824 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 IRF9Q00978 393 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TEPPQ6URK8 271 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms