RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX21	Q969T3	373 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK1	Q96PY6	1258 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH7	P12883	1935 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AK9	Q5TCS8	1911 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLTPD2	A6NH11	291 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF213	O14771	459 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORC4	O43929	436 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENTPD3	O75355	529 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLC	Q05315	142 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC23A	Q15436	765 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	HACL1	Q9UJ83	578 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FZD1	Q9UP38	647 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRC1	O43663	620 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1B1	P15121	316 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOV	P48745	357 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASA3	Q14644	834 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ME3	Q16798	604 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZUG5	572 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM151A	Q8WW52	585 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIPA1L1	O43166	1804 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADM5	C9JUS6	153 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTR3B	O95264	441 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTDNEP1	O95476	244 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB2	P05107	769 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCC	P23508	829 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDIT3	P35638	169 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAP2	P40123	477 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVC	P57679	992 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL16	Q8N461	479 aa		7.21	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms