RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 COBLO75128 1261 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 SLC1A4P43007 532 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 GNG11P61952 73 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 DHX58Q96C10 678 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 MAML3Q96JK9 1138 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 RNF40O75150 1001 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 FSBPO95073 299 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TUBBP07437 444 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CPA1P15085 419 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 DTNBO60941 627 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ZBED4O75132 1171 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 PHACTR2O75167 634 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CIITAP33076 1130 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 PRPHP41219 470 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CCT5P48643 541 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 KCNB1Q14721 858 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 SPATA21Q7Z572 469 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ACAD9Q9H845 621 aa8.49□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 KLRF2D3W0D1 207 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP6O43182 974 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CDKL5O76039 1030 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 STAT3P40763 770 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 LBX1P52954 281 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 LHX8Q68G74 356 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CEP112Q8N8E3 955 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 TRPA1O75762 1119 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 HOXD10P28358 340 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 RGS2P41220 211 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TMEM139Q8IV31 216 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 NECAB1Q8N987 351 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 AGAP3Q96P47 875 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 EPAS1Q99814 870 aa8.48□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.48□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TRPV1Q8NER1 839 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CFAP45Q9UL16 551 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ENO4A6NNW6 628 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 FLOT1O75955 427 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP4-211ENST00000485450 TUBB2AQ13885 445 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TRIB2Q92519 343 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 CPA4Q9UI42 421 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 GABRQQ9UN88 632 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 A0A087WWV3 80 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 ZBTB43O43298 467 aa8.47□□□□□ -1.05
USP4-211ENST00000485450 HMGCRP04035 888 aa8.47□□□□□ -1.05
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