RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 MISP3Q96FF7 219 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 EMC7Q9NPA0 242 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 OBP2AQ9NY56 170 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 VAV3Q9UKW4 847 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ERBINQ96RT1 1412 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF1AQ12756 1690 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 VSTM5A8MXK1 200 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 STXBP3O00186 592 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 MEIS1O00470 390 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-CO1P00395 513 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SRFP11831 508 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CTSKP43235 329 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR85P60893 370 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC103Q8IW40 242 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SVIPQ8NHG7 77 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 IL17RAQ96F46 866 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 STK32BQ9NY57 414 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 KANK1Q14678 1352 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TECPR2O15040 1411 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SIGLEC6O43699 453 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF1O95521 474 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 LCP1P13796 627 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 LSSP48449 732 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ABI1Q8IZP0 508 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2FQ969M7 185 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TIFAQ96CG3 184 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD8Q96I13 439 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST7Q9NS84 486 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP162Q5TB80 1403 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PAPPAQ13219 1627 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GAS7O60861 476 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TESK1Q15569 626 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM177Q53S58 311 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB11Q8WXH4 323 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR27Q9NS67 375 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.15□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 AURKAO14965 403 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CD3EP07766 207 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PF4V1P10720 104 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNGR1P15260 489 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 NAT1P18440 290 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms