RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.08■□□□□ 0.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.08■□□□□ 0.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B4E1Z4 1266 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITIH3Q06033 890 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRX1Q86UT6 975 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOMER1Q86YM7 354 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLG1Q92896 1179 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOL5Q9BWW9 433 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZSWIM5Q9P217 1185 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KAT6AQ92794 2004 aa19.08■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS13AQ96RL7 3174 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARK3P27448 753 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GATMP50440 423 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASP10Q92851 521 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.07■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBKBP1A7MCY6 615 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2CD4DB7Z1M9 353 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAG3P18627 525 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCB3Q01970 1234 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLPP4Q5VZY2 271 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LLGL2Q6P1M3 1020 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDHR1Q96JP9 859 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCF25Q9BQ70 676 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT23Q9C075 422 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAM7Q9H2U9 754 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.06■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTHFRP42898 656 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGBP1P78318 339 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCD3Q8N3E9 789 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIGSQ96S52 555 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POMKQ9H5K3 350 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNNM2Q9H8M5 875 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.05■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ODR4Q5SWX8 454 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NME8Q8N427 588 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPRASP2Q96D09 838 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMX1Q9H3N1 280 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMDP11532 3685 aa19.04■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DENND3A2RUS2 1198 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INSRRP14616 1297 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE1AP54750 535 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLCNQ8NFG4 579 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUL5Q93034 780 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RMDN1Q96DB5 314 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF292O60281 2723 aa19.03■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIDE1A8MVS5 230 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNA2P16389 499 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AOC1P19801 751 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPM1AP35813 382 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT76Q01546 638 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT17Q04695 432 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOBRQ0VD83 1088 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGPT1Q15389 498 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM102BQ5T8I3 360 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMOC2Q9H3U7 446 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS18Q9NS28 235 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USTQ9Y2C2 406 aa19.02■□□□□ 0.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMNAP02545 664 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASGR2P07307 311 aa19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC7Q7Z402 723 aa19.01■□□□□ 0.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAM2Q99965 735 aa19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.1 ms