RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SOX10P56693 466 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CORO7P57737 925 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NR1H3Q13133 447 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MCM6Q14566 821 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDB1Q16531 1140 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPAL2Q16609 132 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCRLBQ6BAA4 426 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASPHD2Q6ICH7 369 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L6PQ6QN14 398 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD300LDQ6UXZ3 194 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM64Q6YI46 380 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMC7Q7Z402 723 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF438Q7Z4V0 828 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GJD3Q8N144 294 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DTWD2Q8NBA8 298 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF507Q8TCN5 953 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SARAFQ96BY9 339 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIPSLA2A3N6 862 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HMX3A6NHT5 357 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 J3KR12 359 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF862O60290 1169 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 B3GALT4O96024 378 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EGFP01133 1207 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FGBP02675 491 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 P0C879 139 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MPLP40238 635 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PMP22Q01453 160 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLE4Q04727 773 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM189A2Q15884 450 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLFNL1Q499Z3 407 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SYT12Q8IV01 421 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BMPERQ8N8U9 685 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSMRQ99650 979 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SCRT1Q9BWW7 348 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPR87Q9BY21 358 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD93Q9NPY3 652 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRDM8Q9NQV8 689 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCFL5Q9UL49 500 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTPN22Q9Y2R2 807 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAST3O60307 1309 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM82A0PJX8 343 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM200CA6NKL6 621 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WNT9AO14904 365 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CKMP06732 381 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NGFRP08138 427 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GLIPR1P48060 266 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PXNP49023 591 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POU5F1BQ06416 359 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADAM9Q13443 819 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf91Q3C1V1 193 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C14orf177Q52M58 125 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC18B1Q6NT16 456 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q6ZRM9 215 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf53Q8IXP5 236 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM192Q8IY95 271 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NANOGP1Q8N7R0 232 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NETO2Q8NC67 525 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DAGLBQ8NCG7 672 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00116Q8NCU8 138 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIN3Q8TB24 985 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RADILQ96JH8 1075 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TIMP4Q99727 224 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BEGAINQ9BUH8 593 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PMS2P1A4D2B8 440 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IRF6O14896 467 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLHL18O94889 574 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARIH2O95376 493 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NTF4P34130 210 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC6A11P48066 632 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NKX3-2P78367 333 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IRF5Q13568 498 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KEAP1Q14145 624 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADGRA1Q86SQ6 560 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLEC14AQ86T13 490 aa-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms