RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TET1Q8NFU7 2136 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-201ENST00000293922 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-201ENST00000293922 NBNO60934 754 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 BMP15O95972 392 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CXCL10P02778 98 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ACTN1P12814 892 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ADAM17P78536 824 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 PTPAQ15257 358 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 NFASCO94856 1347 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 FAM86B1E9PN63 330 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 TDP2O95551 362 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 MBTPS1Q14703 1052 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SLC39A14Q15043 492 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ZNF174Q15697 407 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ZNF576Q9H609 170 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 TRANK1O15050 2925 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 MCM7P33993 719 aa20.56■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ZNF76P36508 570 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 RAB30Q15771 203 aa20.56■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 RABGGTBP53611 331 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 TCTN1Q2MV58 587 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 GLG1Q92896 1179 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SPATA32Q96LK8 384 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SDF4Q9BRK5 362 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 EMSYQ7Z589 1322 aa20.55■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 NRCAMQ92823 1304 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 BAIAP3O94812 1187 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 Q4G0T1 1027 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 LENG9Q96B70 501 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 SPTLC2O15270 562 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SLC37A4O43826 429 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 RSPH10BP0C881 870 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 MYOGP15173 224 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SLC9A7Q96T83 725 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 VCANP13611 3396 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 ATG7O95352 703 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 CCNE2O96020 404 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 PPFIA1Q13136 1202 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTX4-201ENST00000293922 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.53■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTX4-201ENST00000293922 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
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PTX4-201ENST00000293922 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 GRIK4Q16099 956 aa20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 PRR16Q569H4 304 aa20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 MTMR9Q96QG7 549 aa20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.52■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 TCHHQ07283 1943 aa20.51■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 GBF1Q92538 1859 aa20.51■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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