RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf19Q8IY42 314 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RX5Q93086 422 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN18Q99952 460 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 FSTL1Q12841 308 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPPQ6IPU0 288 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 BANK1Q8NDB2 785 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINC1P01008 464 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 YY1P25490 414 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 UBASH3AP57075 661 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMC5P62195 406 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SPAG1Q07617 926 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 HPS3Q969F9 1004 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 REEP2Q9BRK0 252 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PORCNQ9H237 461 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 THAP9Q9H5L6 903 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 GAP43P17677 238 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMM50Q9Y512 469 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFB3P10600 412 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 GUCY2CP25092 1073 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SPC24Q8NBT2 197 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCC1Q9HA90 598 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GTH6 734 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB39O15060 712 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 STRNO43815 780 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ATG7O95352 703 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 RGMBQ6NW40 437 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 DRC7Q8IY82 874 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF20AO95235 890 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PGK2P07205 417 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 PSAPP07602 524 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF131P52739 623 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SP2Q02086 613 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC63Q05C16 580 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-207ENST00000589146 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC10A3P09131 477 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RARRES1P49788 294 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTR2P61160 394 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 NR1I3Q14994 352 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 UGCGQ16739 394 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM47Q96LD4 638 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TIPINQ9BVW5 301 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS13Q9NVM9 706 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ASB14A6NK59 587 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 COBLO75128 1261 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 NEDD9Q14511 834 aa25.25■■□□□ 1.63
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