RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 STX6O43752 255 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXKP42681 527 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 HIC1Q14526 733 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR6Q9Y217 621 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFNP31947 248 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAK3P52333 1124 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R5CQ13362 524 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTGISQ16647 500 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.62■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.62■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-208ENST00000566515 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 BECN1Q14457 450 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETD4Q9NVD3 440 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2C9P11712 490 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCB4Q15147 1175 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-208ENST00000566515 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX21Q9UL17 535 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOD1Q9Y239 953 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR52Z1P0C646 297 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP4AP20648 1035 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 RESTQ13127 1097 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 UGCGQ16739 394 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 RDM1Q8NG50 284 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPC6Q9Y210 931 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0355O15063 1070 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGB8P26012 769 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTGDRQ13258 359 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEB3A0JP26 581 aa23.58■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-208ENST00000566515 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.58■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-208ENST00000566515 TREHO43280 583 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 INSRRP14616 1297 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAG1P15918 1043 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIK4Q16099 956 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-208ENST00000566515 BANK1Q8NDB2 785 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRCAMQ92823 1304 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF862O60290 1169 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TECP42680 631 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGBP1P78318 339 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.56■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-208ENST00000566515 HIPK3Q9H422 1215 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNAT1P11488 350 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEMA6NI47 508 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIMP1P01033 207 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2C18P33260 490 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM17P78536 824 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKCEQ02156 737 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKP1Q13835 747 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHA7Q15375 998 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 BADQ92934 168 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 WNT8BQ93098 351 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGL1Q9NZL6 768 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 HBP1O60381 514 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTK7Q13308 1070 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERINC5Q86VE9 423 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 OATP04181 439 aa23.53■■□□□ 1.36
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