RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	MMP1	P03956	469 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	GHR	P10912	638 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	ITGB5	P18084	799 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAJB1	P25685	340 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.28	□□□□□ -0.76	1e-8	■□□□□ 10.4
PCBP2-222	ENST00000552296	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	NHLH1	Q02575	133 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	PCYT2	Q99447	389 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PCBP2-222	ENST00000552296	LINC01565	O15544	149 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	NCK2	O43639	380 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CTNNB1	P35222	781 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ADAM15	Q13444	863 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	WTAP	Q15007	396 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	P2RX5	Q93086	422 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	LY9	Q9HBG7	655 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	EYA4	O95677	639 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CHML	P26374	656 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MRE11	P49959	708 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	GRIK4	Q16099	956 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CACNA1H	O95180	2353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SGSM2	O43147	1006 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	GLP2R	O95838	553 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ITGB1	P05556	798 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SP4	Q02446	784 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TRDN	Q13061	729 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MYL10	Q9BUA6	226 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	DDAH1	O94760	285 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MARK3	P27448	753 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CD52	P31358	61 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CLUL1	Q15846	466 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PCBP2-222	ENST00000552296	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		10.24	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms