RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	NEFL	P07196	543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF76	P36508	570 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	IGBP1	P78318	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	GRB10	Q13322	594 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	NTRK3	Q16288	839 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	ESYT2	A0FGR8	921 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	LPXN	O60711	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	CCNE2	O96020	404 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	GHR	P10912	638 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	INSRR	P14616	1297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	EVC	P57679	992 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	MGAT3	Q09327	533 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	AZI2	Q9H6S1	392 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GCN1-208	ENST00000551549	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	UPP2	O95045	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ATG7	O95352	703 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	CYP3A4	P08684	503 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	IFNAR1	P17181	557 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	STAT5B	P51692	787 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	LPIN1	Q14693	890 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	BACH1	O14867	736 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	EDIL3	O43854	480 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	GNA11	P29992	359 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ERVK-21	P61565	698 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	TFF2	Q03403	129 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	PRR16	Q569H4	304 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	APBB2	Q92870	758 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	PTPRS	Q13332	1948 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ENPP3	O14638	875 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	ATP4A	P20648	1035 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GCN1-208	ENST00000551549	STK3	Q13188	491 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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