RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 TBX21Q9UL17 535 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-255ENST00000498007 WDR81Q562E7 1941 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2C9P11712 490 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 SFNP31947 248 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TRPC6Q9Y210 931 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA0355O15063 1070 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 RAG1P15918 1043 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 HIC1Q14526 733 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 SETD4Q9NVD3 440 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.31■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TXKP42681 527 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PPFIA1Q13136 1202 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PPP2R5CQ13362 524 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PLCB4Q15147 1175 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 HIPK3Q9H422 1215 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 STX6O43752 255 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 OR52Z1P0C646 297 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 ITGB8P26012 769 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 SLC26A2P50443 739 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 IGBP1P78318 339 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 RDM1Q8NG50 284 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR9Q96QG7 549 aa22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 POTEB3A0JP26 581 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 EML1O00423 815 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 BECN1Q14457 450 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 GRIK4Q16099 956 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 UGCGQ16739 394 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 POTEBQ6S5H4 581 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 BRAPQ7Z569 592 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 BADQ92934 168 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR6Q9Y217 621 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 NRCAMQ92823 1304 aa22.28■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TREHO43280 583 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 TIMP1P01033 207 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 GNAT1P11488 350 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 HOXC8P31273 242 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2C18P33260 490 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 BANK1Q8NDB2 785 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 KAT6AQ92794 2004 aa22.27■■□□□ 1.16
HLA-B-255ENST00000498007 INSRRP14616 1297 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 ATP4AP20648 1035 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 PRKCEQ02156 737 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 RESTQ13127 1097 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CEP290O15078 2479 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 POTEMA6NI47 508 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF862O60290 1169 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 OATP04181 439 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CCL23P55773 120 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 PTGDRQ13258 359 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 PTK7Q13308 1070 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 WNT8BQ93098 351 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.25■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 HBP1O60381 514 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TECP42680 631 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 BFSP2Q13515 415 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 EPHA7Q15375 998 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms