RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 VPS33BQ9H267 617 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CD320Q9NPF0 282 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NUP98P52948 1817 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PPP2R1AP30153 589 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 GRAPQ13588 217 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 HDAC8Q9BY41 377 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 GGA3Q9NZ52 723 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ECE2O60344 883 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PEX10O60683 326 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TBC1D8O95759 1140 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 MCM4P33991 863 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 GPSM2P81274 684 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SEZ6Q53EL9 994 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 MOB2Q70IA6 237 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF605Q86T29 641 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NLRP10Q86W26 655 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 DPF2Q92785 391 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDCA5Q96FF9 252 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TCTN2Q96GX1 697 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 EBF1Q9UH73 591 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PSPNO60542 156 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLEC3AO75596 197 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCNFP41002 786 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CRKP46108 304 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF165P49910 485 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 APOBRQ0VD83 1088 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC14A2Q15849 920 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 GK5Q6ZS86 529 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 COPS6Q7L5N1 327 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 RASAL3Q86YV0 1011 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATG4CQ96DT6 458 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBP1Q9NZI7 540 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 POLLQ9UGP5 575 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TCFL5Q9UL49 500 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLCQ05315 142 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NFE2L2Q16236 605 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NKD1Q969G9 470 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM89AQ96GI7 184 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 RTL9Q8NET4 1388 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 TAF1P21675 1872 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KC1-203ENST00000468069 NUAK1O60285 661 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 SEMA7AO75326 666 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 SYPP08247 313 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 LINC00310P59036 64 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 DLG4P78352 724 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 TCIRG1Q13488 830 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 KRT24Q2M2I5 525 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 SHISA4Q96DD7 197 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 MAP6Q96JE9 813 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 HTTP42858 3142 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS6KC1-203ENST00000468069 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms