RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402555.2

HMGB1P20-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 20, humanhuman

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Gene HMGB1P20, Length 677 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P20-201ENST00000402555 PPFIA4O75335 1185 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 STAM2O75886 525 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 LGALS2P05162 132 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 TGFB3P10600 412 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 SCG2P13521 617 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 FECHP22830 423 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 STK3Q13188 491 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 NEDD9Q14511 834 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 NTRK3Q16288 839 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PKN1Q16512 942 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 METTL7BQ6UX53 244 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 NLRX1Q86UT6 975 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 C7orf31Q8N865 590 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 WNT8BQ93098 351 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 GPRASP2Q96D09 838 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 UIMC1Q96RL1 719 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 GPR20Q99678 358 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 ANO3Q9BYT9 981 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZBBXA8MT70 800 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 H3BRB1 525 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 FGBP02675 491 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 ARP10275 920 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 KCNA2P16389 499 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 EVCP57679 992 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 MTMR1Q13613 665 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 RASIP1Q5U651 963 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 SESTD1Q86VW0 696 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 FBXL16Q8N461 479 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 RETREG2Q8NC44 543 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 HERVK_113Q902F9 699 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 GUCD1Q96NT3 240 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 JADE2Q9NQC1 790 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 GBF1Q92538 1859 aa6.59□□□□□ -1.35
HMGB1P20-201ENST00000402555 A0A0C4DFX4 3053 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 TREHO43280 583 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 IQCF3P0C7M6 154 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 CKBP12277 381 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 MYOGP15173 224 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 IFNAR1P17181 557 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 MARK3P27448 753 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 SREBF1P36956 1147 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 RABGGTBP53611 331 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 ARHGAP4P98171 946 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 AP3B2Q13367 1082 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 BFSP2Q13515 415 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 GPNMBQ14956 572 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 TCTN1Q2MV58 587 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 AIFM3Q96NN9 605 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMGB1P20-201ENST00000402555 PBX4Q9BYU1 374 aa6.58□□□□□ -1.36
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