RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ROD1	Q02805	837 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	EAR1	Q03212	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TDA1	Q03533	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SMA2	Q04658	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ATX2	Q12067	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RTN2	Q12443	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AFI1	Q99222	893 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SPS2	P08459	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MET3	P08536	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YUR1	P26725	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
CLF1	YLR117C	SRY1	P36007	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ALG8	P40351	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PGD1	P40356	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LCB2	P40970	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SSY5	P47002	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HXT16	P47185	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PAC10	P48363	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YGR273C	P53329	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RRN9	P53437	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HCH1	P53834	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PEX13	P80667	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	INM2	Q05533	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TMA10	Q06177	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SFM1	Q12314	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CHS1	P08004	1131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SLY1	P22213	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SSS1	P35179	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	OAR1	P35731	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ROT2	P38138	954 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PEX32	P38292	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YAR028W	P39548	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YGR201C	P42936	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SLM2	P53955	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TIM8	P57744	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CLF1	YLR117C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	UGO1	Q03327	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CAC2	Q04199	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FMP25	Q08023	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HFI1	Q12060	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SPC3	Q12133	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PSF3	Q12146	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PNS1	Q12412	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MTR10	Q99189	972 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PRC1	P00729	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ALG7	P07286	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CLF1	YLR117C	ACE2	P21192	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DAL2	P25335	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RHB1	P25378	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	POF1	P25576	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PEX34	P25584	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SNC1	P31109	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ACB1	P31787	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	BCS1	P32839	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MRPL15	P36523	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YBL029W	P38201	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FTH1	P38310	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GAA1	P39012	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ERR3	P42222	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PFA3	P42836	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PMT4	P46971	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GTO1	P48239	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CWC27	Q02770	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AIM33	Q04516	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	THI7	Q05998	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NMD4	Q12129	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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