RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		16.01	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	APOL5	Q9BWW9	433 aa		16.01	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	KRT23	Q9C075	422 aa		16.01	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TRPC6	Q9Y210	931 aa		16.01	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PRR23A	A6NEV1	266 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222		B4E1Z4	1266 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PER2	O15055	1255 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	KRT37	O76014	449 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	NRIP1	P48552	1158 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RASEF	Q8IZ41	740 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		16	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	EMSY	Q7Z589	1322 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	EYA4	O95677	639 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	GATM	P50440	423 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	FOXK2	Q01167	660 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ZNF543	Q08ER8	600 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TRDN	Q13061	729 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PPTC7	Q8NI37	304 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RMDN3	Q96TC7	470 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SETD4	Q9NVD3	440 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		15.99	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	CACNA1H	O95180	2353 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PPFIA3	O75145	1194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ITGB1	P05556	798 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	STXBP2	Q15833	593 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	NCOA7	Q8NI08	942 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	IL31RA	Q8NI17	732 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SPATA33	Q96N06	139 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	NCK2	O43639	380 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MMP1	P03956	469 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	GHR	P10912	638 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ID4	P47928	161 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	LAMC2	Q13753	1193 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	KRT32	Q14532	448 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TRIM50	Q86XT4	487 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	PRRX2	Q99811	253 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		15.97	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	GGPS1	O95749	300 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	CHRNA1	P02708	482 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	NR3C2	P08235	984 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	IQCA1	Q86XH1	822 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	TTC14	Q96N46	770 aa		15.96	■□□□□ 0.15
CS-231	ENST00000552222	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		15.96	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PROB1	E7EW31	1015 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ENPP3	O14638	875 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RB1	P06400	928 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ANTXR2	P58335	489 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	COASY	Q13057	564 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	DGKH	Q86XP1	1220 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ADSSL1	Q8N142	457 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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