RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 H3BNC9 293 aa34.76■■■■□ 3.16
ALYREF-202ENST00000505490 GNAQP50148 359 aa34.76■■■■□ 3.16
ALYREF-202ENST00000505490 TMTC2Q8N394 836 aa34.76■■■■□ 3.16
ALYREF-202ENST00000505490 EHMT1Q9H9B1 1298 aa34.76■■■■□ 3.16
ALYREF-202ENST00000505490 CD320Q9NPF0 282 aa34.76■■■■□ 3.16
ALYREF-202ENST00000505490 ATP9AO75110 1047 aa34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 COL19A1Q14993 1142 aa34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHA8P1O95397 391 aa34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 CHRNA1P02708 482 aa34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP4P98171 946 aa34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 YME1L1Q96TA2 773 aa34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 LRFN3Q9BTN0 628 aa34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 MYO7AQ13402 2215 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PRC1O43663 620 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 ITGB5P18084 799 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G5P39877 138 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 LIFRP42702 1097 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 MGAT3Q09327 533 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 CDHR1Q96JP9 859 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM87BQ96K49 555 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 C11orf16Q9NQ32 467 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 LINC00271P0C7V0 271 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 MCM5P33992 734 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PTPROQ16827 1216 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TAF2Q6P1X5 1199 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 CASC1Q6TDU7 716 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM192Q8IY95 271 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 NEK9Q8TD19 979 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TTC3P53804 2025 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PI4K2BG5E9Z4 385 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 FAM178BQ8IXR5 827 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 PSTPIP2Q9H939 334 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 GPR37L1O60883 481 aa34.7■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 TIGD5Q53EQ6 642 aa34.7■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 RUFY4Q6ZNE9 571 aa34.7■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 SEPT1Q8WYJ6 367 aa34.7■■■■□ 3.15
ALYREF-202ENST00000505490 C5orf67F2Z3F1 127 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 UPP2O95045 317 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CALM1P0DP23 149 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CALM2P0DP24 149 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CALM3P0DP25 149 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 KCNA5P22460 613 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 SP4Q02446 784 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 GPM6BQ13491 265 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 MARCH8Q5T0T0 291 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 ERAP1Q9NZ08 941 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 MAFGO15525 162 aa34.68■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 NECTIN1Q15223 517 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM31Q5JXX7 168 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 BANK1Q8NDB2 785 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 JADE2Q9NQC1 790 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 GRXCR2A6NFK2 248 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC69A6NI79 296 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 PPFIA1Q13136 1202 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 LPIN1Q14693 890 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 SGMS1Q86VZ5 419 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 IL17RAQ96F46 866 aa34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 SLC27A2O14975 620 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 GHRP10912 638 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 RXRAP19793 462 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 MTMR1Q13613 665 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 GRIK4Q16099 956 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 TMTC3Q6ZXV5 915 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 TUBE1Q9UJT0 475 aa34.65■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 ENPP3O14638 875 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 RB1P06400 928 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 IL9P15248 144 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 UBE2SQ16763 222 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO47Q5MNV8 452 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 NFXL1Q6ZNB6 911 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 TEX2Q8IWB9 1127 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 GJD3Q8N144 294 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 PCYT2Q99447 389 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa34.64■■■■□ 3.14
ALYREF-202ENST00000505490 TCEAL5Q5H9L2 206 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-202ENST00000505490 CRIPAKQ8N1N5 446 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-202ENST00000505490 FANCBQ8NB91 859 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-202ENST00000505490 FAM122AQ96E09 287 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-202ENST00000505490 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms