RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.29■■□□□ 1.96
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SMKR1-201ENST00000462322 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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SMKR1-201ENST00000462322 TBCKQ8TEA7 893 aa27.22■■□□□ 1.95
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SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27.21■■□□□ 1.95
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SMKR1-201ENST00000462322 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.2■■□□□ 1.94
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SMKR1-201ENST00000462322 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.19■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.19■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RSPH10B2B2RC85 870 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 BACH1O14867 736 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RSPH10BP0C881 870 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.18■■□□□ 1.94
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