RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 RTP1P59025 263 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM192Q8IY95 271 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 UBP1Q9NZI7 540 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 N4BP3O15049 544 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC3AO75596 197 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CTSKP43235 329 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CDR1P51861 262 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC93Q567U6 631 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CHST7Q9NS84 486 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RNF186Q9NXI6 227 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RTL1A6NKG5 1358 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 KDRP35968 1356 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 PHKG2P15735 406 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SEZ6Q53EL9 994 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 STYK1Q6J9G0 422 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SYNE4Q8N205 404 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 NARFQ9UHQ1 456 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 MEIS1O00470 390 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 CCNFP41002 786 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 HUNKP57058 714 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 GK5Q6ZS86 529 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF205O95201 554 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 MZB1Q8WU39 189 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 MASTLQ96GX5 879 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A18Q96N87 628 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 INSRP06213 1382 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 FZD9O00144 591 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF10CO14798 259 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 BMP8BP34820 402 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 EPS15P42566 896 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 ST5P78524 1137 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 VMACQ2NL98 169 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 RGMBQ6NW40 437 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A7Q96T83 725 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 GGT7Q9UJ14 662 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 PRKCAP17252 672 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 APOBRQ0VD83 1088 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 TMC6Q7Z403 805 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 FAM129CQ86XR2 697 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-211ENST00000429595 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms