RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403888.7

KCTD17-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD17, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-202ENST00000403888 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.13■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 MCF2L2Q86YR7 1114 aa29.13■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.13■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.13■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 ZNF536O15090 1300 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 RPTORQ8N122 1335 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 EML1O00423 815 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TADA3O75528 432 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 GAP43P17677 238 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 PRELPP51888 382 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 REEP2Q9BRK0 252 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 KLK7P49862 253 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 KCND2Q9NZV8 630 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 INPP5BP32019 993 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 UBXN4Q92575 508 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 RIT2Q99578 217 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 OLFML3Q9NRN5 406 aa29.11■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 GAS7O60861 476 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FDX1P10109 184 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 ZNF569Q5MCW4 686 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TRIM59Q8IWR1 403 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NEK9Q8TD19 979 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CARD6Q9BX69 1037 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.1■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 SHTN1A0MZ66 631 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CTAGE9A4FU28 777 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 SLITRK3O94933 977 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TUBB4BP68371 445 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.09■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 FZD9O00144 591 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 PDXKO00764 312 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CETN3O15182 167 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 PPP2R3AQ06190 1150 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 EPHA7Q15375 998 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 V9GYY5 206 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 A0A0U1RQJ8 604 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 USP14P54578 494 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CYP4A11Q02928 519 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 SFR1Q86XK3 245 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 ATRIPQ8WXE1 791 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 HOOK2Q96ED9 719 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 CDC23Q9UJX2 597 aa29.08■■■□□ 2.25
KCTD17-202ENST00000403888 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 NELFCDQ8IXH7 590 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 MICALL2Q8IY33 904 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 LRRN4CLQ8ND94 238 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 NACC1Q96RE7 527 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 RGL1Q9NZL6 768 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 FRMPD4Q14CM0 1322 aa29.07■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 ADAM9Q13443 819 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 DCAF15Q66K64 600 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 FRMD5Q7Z6J6 570 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 NEK11Q8NG66 645 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 MMRN2Q9H8L6 949 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 SEL1LQ9UBV2 794 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 HERVK_113P62684 666 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 SLC35F6Q8N357 371 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 DYDC2Q96IM9 177 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 ZHX3Q9H4I2 956 aa29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 DOCK1Q14185 1865 aa29.05■■■□□ 2.24
KCTD17-202ENST00000403888 KRT86O43790 486 aa29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.8 ms