RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDDC3-201ENST00000330334 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.27■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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HDDC3-201ENST00000330334 SEPT8Q92599 483 aa20.25■□□□□ 0.83
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HDDC3-201ENST00000330334 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.25■□□□□ 0.83
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HDDC3-201ENST00000330334 ARP10275 920 aa20.24■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 GNA11P29992 359 aa20.24■□□□□ 0.83
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HDDC3-201ENST00000330334 AMHP03971 560 aa20.23■□□□□ 0.83
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HDDC3-201ENST00000330334 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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HDDC3-201ENST00000330334 AZI2Q9H6S1 392 aa20.23■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.23■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 INSL6Q9Y581 213 aa20.23■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 TTC28Q96AY4 2481 aa20.22■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGEF15O94989 841 aa20.22■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF76P36508 570 aa20.22■□□□□ 0.83
HDDC3-201ENST00000330334 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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