RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GSDMAQ96QA5 445 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 BACH1O14867 736 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 N4BP3O15049 544 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PSMD10O75832 226 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PRPHP41219 470 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PAK1Q13153 545 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PANK4Q9NVE7 773 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 BTBD19C9JJ37 291 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARIH2O95376 493 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GJB1P08034 283 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RAB34Q9BZG1 259 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 B4DLN1 442 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 COASYQ13057 564 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 KRT31Q15323 416 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 UVSSAQ2YD98 709 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 LBX2Q6XYB7 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MLKLQ8NB16 471 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 BRI3BPQ8WY22 251 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DNM3Q9UQ16 869 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HSD17B4P51659 736 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PDHXO00330 501 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF862O60290 1169 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GRIN3BO60391 1043 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GCNT3O95395 438 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CASP4P49662 377 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 KANK3Q6NY19 840 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ADSSL1Q8N142 457 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MYCT1Q8N699 235 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARID3AQ99856 593 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ACAD9Q9H845 621 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 POTEB2H3BUK9 544 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ABL1P00519 1130 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SKILP12757 684 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 C19orf81C9J6K1 198 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PIK3CDO00329 1044 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MMP14P50281 582 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 AK8Q96MA6 479 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 LAD1O00515 517 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RPA1P27694 616 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARID5AQ03989 594 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DRP2Q13474 957 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MOGSQ13724 837 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GIT2Q14161 759 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PDIA5Q14554 519 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SEZ6Q53EL9 994 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RNF19AQ9NV58 838 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GINS2Q9Y248 185 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SMTNL1A8MU46 457 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 KCNJ18B7U540 433 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 EPHB6O15197 1021 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms