RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C IPP1P00817 287 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COR1P07256 457 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DST1P07273 309 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PUT2P07275 575 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COS2P0CX12 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COS3P0CX13 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HAP4P14064 554 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C KSS1P14681 368 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC26P14724 124 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C THR1P17423 357 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HOP1P20050 605 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPB5P20434 215 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MCK1P21965 375 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NPR1P22211 790 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C APN1P22936 367 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NAR1P23503 491 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SCO1P23833 295 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CLB3P24870 427 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NPP1P25353 742 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GFD2P25370 566 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NFS1P25374 497 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DMC1P25453 334 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MGR1P25573 417 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR102CP25608 368 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CSM1P25651 190 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CMK1P27466 446 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD14P28519 371 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YIM1P28625 365 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C EHD3P28817 500 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ATS1P31386 333 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PDB1P32473 366 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HOG1P32485 435 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C LYP1P32487 611 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C EMP70P32802 667 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ATO2P32907 282 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C LOT5P34234 306 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PTC1P35182 281 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM15P35195 104 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HES1P35843 434 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR062CP36025 268 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YKR073CP36153 106 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C OMA1P36163 345 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SKG1P36169 355 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL17P36528 281 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CBP4P37267 147 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BNA4P38169 460 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MOH1P38191 138 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data0.65□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG14P38270 344 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR262WP38430 313 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RFC3P38629 340 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YHL037CP38733 133 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TRR2P38816 342 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BZZ1P38822 633 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ANS1P38832 159 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX18P38855 283 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR177WP38867 453 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS41P38959 992 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MNN9P39107 395 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL206CP39529 758 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RCY1P39531 840 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C LSM5P40089 93 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FAU1P40099 211 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MGS1P40151 587 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE6P40303 254 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C QDR2P40474 542 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP25P40498 721 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C VHR1P40522 640 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NEO1P40527 1151 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PKP1P40530 394 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM2P40534 656 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RLP7P40693 322 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNM1P40993 198 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC26P41810 973 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YRB1P41920 201 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ELP2P42935 788 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COS4P43542 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FAR3P46671 204 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TRS85P46944 698 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IKS1P47042 667 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IBA57P47158 497 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PGU1P47180 361 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GTO1P48239 356 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GPI8P49018 411 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C KEL2P50090 882 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IMD4P50094 524 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ROM1P53046 1155 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SDT1P53078 280 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MRM2P53123 320 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPN14P53196 417 aa0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64 ms