RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)B

tT(AGU)B, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)BtT(AGU)B IPP1P00817 287 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B COR1P07256 457 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B DST1P07273 309 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PUT2P07275 575 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B COS2P0CX12 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B COS3P0CX13 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B GCD2P12754 651 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B KIN2P13186 1147 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HAP4P14064 554 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B KSS1P14681 368 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B CDC26P14724 124 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B THR1P17423 357 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HOP1P20050 605 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RPB5P20434 215 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MCK1P21965 375 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B NPR1P22211 790 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B APN1P22936 367 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RPS1BP23248 255 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B NAR1P23503 491 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B SCO1P23833 295 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B CLB3P24870 427 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B NPP1P25353 742 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B GFD2P25370 566 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B NFS1P25374 497 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B DMC1P25453 334 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MGR1P25573 417 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YCR102CP25608 368 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B CSM1P25651 190 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B CMK1P27466 446 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RAD14P28519 371 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YIM1P28625 365 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B EHD3P28817 500 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ATS1P31386 333 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B AAR2P32357 355 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PDB1P32473 366 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HOG1P32485 435 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B LYP1P32487 611 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B EMP70P32802 667 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ATO2P32907 282 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B LOT5P34234 306 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PTC1P35182 281 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ECM15P35195 104 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HES1P35843 434 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YOR062CP36025 268 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YKR073CP36153 106 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B OMA1P36163 345 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B SKG1P36169 355 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MRPL17P36528 281 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B CBP4P37267 147 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B BNA4P38169 460 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MOH1P38191 138 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data0.65□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B ATG14P38270 344 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B TSL1P38427 1098 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR262WP38430 313 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RFC3P38629 340 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YHL037CP38733 133 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B TRR2P38816 342 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B BZZ1P38822 633 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ANS1P38832 159 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PEX18P38855 283 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YHR177WP38867 453 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B VPS41P38959 992 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MNN9P39107 395 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YJL206CP39529 758 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RCY1P39531 840 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PTI1P39927 425 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B LSM5P40089 93 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B FAU1P40099 211 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MGS1P40151 587 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PRE6P40303 254 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B QDR2P40474 542 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B UTP25P40498 721 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B VHR1P40522 640 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B NEO1P40527 1151 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PKP1P40530 394 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PRM2P40534 656 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RLP7P40693 322 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B SNM1P40993 198 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B SEC26P41810 973 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B YRB1P41920 201 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ELP2P42935 788 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B COS4P43542 379 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B FAR3P46671 204 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B TRS85P46944 698 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B IKS1P47042 667 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B IBA57P47158 497 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B PGU1P47180 361 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B GTO1P48239 356 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B GPI8P49018 411 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B KEL2P50090 882 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B IMD4P50094 524 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B ROM1P53046 1155 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B SDT1P53078 280 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B MRM2P53123 320 aa0.65□□□□□ -2.31
tT(AGU)BtT(AGU)B RPN14P53196 417 aa0.65□□□□□ -2.31
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