RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604609.2

GDF15-205, Transcript of growth differentiation factor 15, human

TSL 3

Gene GDF15, Length 506 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDF15-205	ENST00000604609	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609		A0A087WWV3	80 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PSMD10	O75832	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	STAM2	O75886	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GH1	P01241	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	TXK	P42681	527 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PSMC6	P62333	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PTGDR	Q13258	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PTPA	Q15257	358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	LRRC41	Q15345	812 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	CALCRL	Q16602	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	SPATA33	Q96N06	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	PCYT2	Q99447	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	POTEM	A6NI47	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	SGPL1	O95470	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GJB1	P08034	283 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MMP3	P08254	477 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GJA9	P57773	515 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	ACTR2	P61160	394 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	UGCG	Q16739	394 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	GPR20	Q99678	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GDF15-205	ENST00000604609	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	GAS7	O60861	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	MYL3	P08590	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TGFB3	P10600	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	CDC25A	P30304	524 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TEC	P42680	631 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	GJA8	P48165	433 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	KCNA10	Q16322	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	KAT2B	Q92831	832 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	NFASC	O94856	1347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609		A6NJR5	290 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	MARK3	P27448	753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	NEDD9	Q14511	834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	HIC1	Q14526	733 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GDF15-205	ENST00000604609	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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