RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 BBOX1O75936 387 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 FSBPO95073 299 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ATP2B4P23634 1241 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 NFIAQ12857 509 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SLC15A2Q16348 729 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CFAP221Q4G0U5 840 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 VWA3BQ502W6 1294 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CABP7Q86V35 215 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 NLRP14Q86W24 1093 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 PALMO75781 387 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ARID5AQ03989 594 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 FAM114A1Q8IWE2 563 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 NOX5Q96PH1 765 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 GDF3Q9NR23 364 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 TECP42680 631 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DYMQ7RTS9 669 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC13Q8IYE1 715 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 GLIS3Q8NEA6 775 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 UIMC1Q96RL1 719 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 PLAAQ9Y263 795 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF831Q5JPB2 1677 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 FLT1P17948 1338 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CALML3P27482 149 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 EHHADHQ08426 723 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 LETM2Q2VYF4 491 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 FIGNQ5HY92 759 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 PAK2Q13177 524 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 BAP1Q92560 729 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 GOLPH3Q9H4A6 298 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ATP2C2O75185 946 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 LRRC41Q15345 812 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 KLC4Q9NSK0 619 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 RAD51CO43502 376 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 LCA5LO95447 670 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 NPR1P16066 1061 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 TMOD1P28289 359 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 TNFRSF8P28908 595 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 RUBCNQ92622 972 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 H0YIN7 160 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 M0R2N6 131 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 KLRC1P26715 233 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 PACSIN1Q9BY11 444 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-208ENST00000595033 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 RAD17O75943 681 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 TSPY3P0CV98 308 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 TSPY8P0CW00 308 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 QPCTQ16769 361 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 C12orf60Q5U649 245 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 HGSNATQ68CP4 663 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 SP8Q8IXZ3 490 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 VCPKMTQ9H867 229 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 STK32BQ9NY57 414 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-208ENST00000595033 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms