RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ECE2O60344 883 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NPR1P16066 1061 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 AMPD3Q01432 767 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CHMP2AO43633 222 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MMS19Q96T76 1030 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NDST4Q9H3R1 872 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 F5H6K3 240 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 SNHG28P0DPA3 235 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 VSNL1P62760 191 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ICA1Q05084 483 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 KLRC3Q07444 240 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MED24O75448 989 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RAD17O75943 681 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CASP5P51878 434 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 JADE2Q9NQC1 790 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 PANK4Q9NVE7 773 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MYO6Q9UM54 1294 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PRG0 241 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 TUBB4AP04350 444 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 COASYQ13057 564 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 GPBP1Q86WP2 473 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CCDC51Q96ER9 411 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ABCB6Q9NP58 842 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 BCS1LQ9Y276 419 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 LRRC53A6NM62 1247 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NCK2O43639 380 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 C21orf2O43822 256 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CCDC42Q96M95 316 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC7Q99615 494 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 BICDL2A1A5D9 508 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 BUB1O43683 1085 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RSPH10BP0C881 870 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 CCDC174Q6PII3 467 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 UNC13DQ70J99 1090 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 KSR1Q8IVT5 923 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ANO3Q9BYT9 981 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 RGL1Q9NZL6 768 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 VPS18Q9P253 973 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MOCS3O95396 460 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 POLD1P28340 1107 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 VWA3BQ502W6 1294 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CENPPQ6IPU0 288 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 ACER1Q8TDN7 264 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 FAM86B1E9PN63 330 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 NDUFB10O96000 172 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 KCNA1Q09470 495 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 RABGGTAQ92696 567 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 IVLP07476 585 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE8P0CG41 777 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE6Q86UF2 777 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE4Q8IX94 777 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 EXOC4Q96A65 974 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 MASTLQ96GX5 879 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms