RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 SNAP25P60880 206 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 ARSHQ5FYA8 562 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 COG1Q8WTW3 980 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 SCFD1Q8WVM8 642 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC66A2RUB6 948 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 TLR2O60603 784 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 ALDH1B1P30837 517 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 MAGEA1P43355 309 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC65Q8IXS2 484 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CAGE1Q8TC20 777 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 DCAF4Q8WV16 495 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 DRC1Q96MC2 740 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 APBA1Q02410 837 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 C2orf54Q08AI8 447 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 GPS2Q13227 327 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP63Q96MT8 703 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 VPS18Q9P253 973 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 PJA2O43164 708 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC12A3P55017 1021 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 EXOC4Q96A65 974 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 SIPA1L1O43166 1804 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 POTEFA5A3E0 1075 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 POTEIP0CG38 1075 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 MYBL2P10244 700 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 PSMC6P62333 389 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGAP4P98171 946 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 POTEGQ6S5H5 508 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 PODNQ7Z5L7 613 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 NLGN1Q8N2Q7 840 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54-210ENST00000498417 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 FRMD3A2A2Y4 597 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MARSP56192 900 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 RASSF7Q02833 373 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP72Q9P209 647 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 PRLRP16471 622 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 PRR16Q569H4 304 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 IDI2Q9BXS1 227 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 PSD3Q9NYI0 1048 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 NRXN2Q9P2S2 1712 aa17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 F5H6K3 240 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 CASP5P51878 434 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 JAG1P78504 1218 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 KLRC3Q07444 240 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MOXD1Q6UVY6 613 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 TXLNBQ8N3L3 684 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC102AQ96A19 550 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 LENG9Q96B70 501 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MASTLQ96GX5 879 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 OSBPL9Q96SU4 736 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 HINFPQ9BQA5 517 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MRIQ9BWK5 157 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 NCK2O43639 380 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 GDF11O95390 407 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MCM3P25205 808 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 ICA1Q05084 483 aa17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 AP3B2Q13367 1082 aa17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms