RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 UPP2O95045 317 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 HOXC8P31273 242 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 HSD17B4P51659 736 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 GHRHRQ02643 423 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.57■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 H3BRB1 525 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 GGPS1O95749 300 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 IRS1P35568 1242 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 LTBRP36941 435 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.56■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 RB1P06400 928 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SP2Q02086 613 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 APBB2Q92870 758 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 IL17RAQ96F46 866 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 AMNQ9BXJ7 453 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.55■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 ZNF213O14771 459 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 TREHO43280 583 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 RPAINQ86UA6 219 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 COL4A6Q14031 1691 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 NEDD4P46934 1319 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.54■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 OPLAHO14841 1288 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 SORBS3O60504 671 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 GNAT1P11488 350 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 FIBCD1Q8N539 461 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 USP26Q9BXU7 913 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.53■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.52■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 KDM4AO75164 1064 aa22.52■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 BMPR1AP36894 532 aa22.52■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 PGM5Q15124 567 aa22.52■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.52■■□□□ 1.2
LTB-210ENST00000429299 MYH6P13533 1939 aa22.51■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CTNNB1P35222 781 aa22.51■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 FAM26DQ5JW98 314 aa22.51■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 MBTPS2O43462 519 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 LGALS2P05162 132 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CTSHP09668 335 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 PDE4AP27815 886 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 HYAL1Q12794 435 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 RNF135Q8IUD6 432 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 TECTAO75443 2155 aa22.5■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 GRM6O15303 877 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CCND2P30279 289 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 EDAQ92838 391 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 RILPL2Q969X0 211 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 MTMR8Q96EF0 704 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 SETD4Q9NVD3 440 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.49■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 ZBTB5O15062 677 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 LINC00271P0C7V0 271 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 TRAF1Q13077 416 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CLUL1Q15846 466 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 PKN1Q16512 942 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 IL31RAQ8NI17 732 aa22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 B4E1Z4 1266 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 KLRF2D3W0D1 207 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms