RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf47	A7E2U8	309 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SRF	P11831	508 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PRORY	Q9H606	182 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	F8	P00451	2351 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	NF1	P21359	2839 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GDF11	O95390	407 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CR2	P20023	1033 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	COG2	Q14746	738 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB124	Q8NES8	71 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	AXIN1	O15169	862 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	C8B	P07358	591 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	WEE2	P0C1S8	567 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	STARD6	P59095	220 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	JAG1	P78504	1218 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNC3	Q14003	757 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGIS	Q16647	500 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP10	Q92851	521 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR20	Q99678	358 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CKB	P12277	381 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	C6	P13671	934 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PCSK4	Q6UW60	755 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP68	Q76N32	757 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	BLACE	A4D250	179 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	MYL3	P08590	195 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDX5	P30044	214 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF76	P36508	570 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	RBL2	Q08999	1139 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ARMCX2	Q7L311	632 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX11	Q96FC9	970 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC32A1	Q9H598	525 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SNAP23-223	ENST00000627440	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
SNAP23-223	ENST00000627440	EMSY	Q7Z589	1322 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SNAP23-223	ENST00000627440	HR	O43593	1189 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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