RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510921.5

CCNH-208, Transcript of cyclin H, human

TSL 4

Gene CCNH, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-208	ENST00000510921	DDAH1	O94760	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PLAT	P00750	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LTBR	P36941	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ETFB	P38117	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	GFRA1	P56159	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	NKX3-2	P78367	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LSAMP	Q13449	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FXN	Q16595	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LGI4	Q8N135	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	EPN3	Q9H201	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	STAT5A	P42229	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ARID5A	Q03989	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ADAM9	Q13443	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FGR	P09769	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LCP1	P13796	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	KCNJ6	P48051	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ADAM17	P78536	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	GML	Q99445	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	3e-9	■□□□□ 9.3
CCNH-208	ENST00000510921	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921		B2RBV5	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	DGKI	O75912	1065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LRG1	P02750	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF28	P17035	718 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	IL13	P35225	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CPZ	Q66K79	652 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CYP7B1	O75881	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	GJB6	O95452	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	GRIA2	P42262	883 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SURF1	Q15526	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921		A0A1W2PQU0	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	AGRP	O00253	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	B4GALT3	O60512	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	MAFK	O60675	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNH-208	ENST00000510921	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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