RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-217ENST00000510204 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.9□□□□□ -0.34
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 HESX1Q9UBX0 185 aa12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 CYP4A11Q02928 519 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 MYO1HQ8N1T3 1032 aa12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 PHKG2P15735 406 aa12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 IFT43Q96FT9 208 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 GYPCP04921 128 aa12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-217ENST00000510204 LMNTD2Q8IXW0 634 aa12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 CFAP157Q5JU67 520 aa12.87□□□□□ -0.35
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SH3BP2-217ENST00000510204 MRC1P22897 1456 aa12.87□□□□□ -0.35
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