RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-209	ENST00000479976	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	C7orf31	Q8N865	590 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	SCN5A	Q14524	2016 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CHTF18-209	ENST00000479976	ZBBX	A8MT70	800 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	HAS3	O00219	553 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	STAM2	O75886	525 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	F2	P00734	622 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	ZNF286B	P0CG31	522 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	MFSD10	Q14728	455 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	CAGE1	Q8TC20	777 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	CUL5	Q93034	780 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	ALG1	Q9BT22	464 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	PIK3CD	O00329	1044 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SORBS3	O60504	671 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	FANCB	Q8NB91	859 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	MEIS2	O14770	477 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	ACTN1	P12814	892 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	32.8	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	NEK1	Q96PY6	1258 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	ICAM3	P32942	547 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	CDC45	O75419	566 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	32.78	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	RABGGTB	P53611	331 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	GBF1	Q92538	1859 aa		32.76	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		32.76	■■■□□ 2.84
CHTF18-209	ENST00000479976	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	NEDD9	Q14511	834 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	MICU3	Q86XE3	530 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	MYO9B	Q13459	2157 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	FIBP	O43427	364 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	SELP	P16109	830 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	RBL2	Q08999	1139 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	SEMA3F	Q13275	785 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PTK7	Q13308	1070 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	RASEF	Q8IZ41	740 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	TET1	Q8NFU7	2136 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	CKB	P12277	381 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	APOA5	Q6Q788	366 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	METTL7B	Q6UX53	244 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976		H3BRB1	525 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	GPNMB	Q14956	572 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	USP26	Q9BXU7	913 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	MYOG	P15173	224 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	KRT32	Q14532	448 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	NLRX1	Q86UT6	975 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	SLC9A7	Q96T83	725 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	BAIAP3	O94812	1187 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CHTF18-209	ENST00000479976	LGALS2	P05162	132 aa		32.7	■■■□□ 2.83

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