RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 VPS18Q9P253 973 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FOCADQ5VW36 1801 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TRAF5O00463 557 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TRIM58Q8NG06 486 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 DRC1Q96MC2 740 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 E9PMD0 336 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PROM2Q8N271 834 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CCDC102AQ96A19 550 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SH2D4AQ9H788 454 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FAM196BA6NMK8 535 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TACC1O75410 805 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MTMR8Q96EF0 704 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MOCS3O95396 460 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SEPT2Q15019 361 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 BAP1Q92560 729 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 AFF2P51816 1311 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MCM3P25205 808 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SLC1A4P43007 532 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CACNB3P54284 484 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TCP10Q12799 353 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 LTBP1Q14766 1721 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 POTEB3A0JP26 581 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 POTECB2RU33 542 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ZMYND10O75800 440 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 POTEBQ6S5H4 581 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G4BP0C869 781 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC18Q9H819 358 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 SNX12Q9UMY4 172 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 LMAN1P49257 510 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 C2orf54Q08AI8 447 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MAP9Q49MG5 647 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 HYIQ5T013 277 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 IQCEQ6IPM2 695 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PDXDC1Q6P996 788 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 GPBP1Q86WP2 473 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 EXOC4Q96A65 974 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CCDC17Q96LX7 622 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 LCA5LO95447 670 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MAGEA1P43355 309 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CRKP46108 304 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 KCNMA1Q12791 1236 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 STAT3P40763 770 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ANO3Q9BYT9 981 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PHACTR2O75167 634 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TRIM37O94972 964 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 EHD4Q9H223 541 aa22.63■■□□□ 1.21
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