RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426280.3

GPC1-204, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPC1, Length 636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-204ENST00000426280 NTRK3Q16288 839 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PKN1Q16512 942 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 C8orf34Q49A92 452 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 TMEM240Q5SV17 173 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 SCLYQ96I15 445 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 ITGB5P18084 799 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 ICAM3P32942 547 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 LAMC2Q13753 1193 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 RUFY3Q7L099 469 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 FBXL16Q8N461 479 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PHKBQ93100 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 ALG1Q9BT22 464 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 HIPK3Q9H422 1215 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 HAS3O00219 553 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 KPNA6O60684 536 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PSEN2P49810 448 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 EVCP57679 992 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 GPNMBQ14956 572 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 ZNF365Q70YC5 407 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 PPTC7Q8NI37 304 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 CUL5Q93034 780 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 WNT8BQ93098 351 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 SPATA33Q96N06 139 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 LAMA3Q16787 3333 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-204ENST00000426280 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 SMCO2A6NFE2 343 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 EDIL3O43854 480 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 NAPAP54920 295 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 FGD1P98174 961 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 DGKDQ16760 1214 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 BARHL2Q9NY43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 NID2Q14112 1375 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PPFIA4O75335 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TGFB3P10600 412 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PSMA5P28066 241 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 MFSD10Q14728 455 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 RASIP1Q5U651 963 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TMEM199Q8N511 208 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 DEFB123Q8N688 67 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 FAM161BQ96MY7 647 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 UIMC1Q96RL1 719 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 GPR20Q99678 358 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 FIBPO43427 364 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 F2P00734 622 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 ARP10275 920 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 KCNA2P16389 499 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 RCAN1P53805 252 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 SP4Q02446 784 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 PTGISQ16647 500 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TCTN1Q2MV58 587 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 SESTD1Q86VW0 696 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TRIM50Q86XT4 487 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 IL23AQ9NPF7 189 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-204ENST00000426280 STAM2O75886 525 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms