RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Taf5lQ91WQ5 589 aa15.02■□□□□ -0
Scn4b-201ENSMUST00000060125 BlvraQ9CY64 295 aa15.02■□□□□ -0
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc40a1Q9JHI9 570 aa15.02■□□□□ -0
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa15.02■□□□□ -0
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trim5E9PV98 497 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atf5O70191 283 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pram1Q6BCL1 675 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klhl38Q8BSF5 581 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MlxiplQ99MZ3 864 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Card9A2AIV8 536 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zbtb38Q3LR78 1197 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Anapc5Q8BTZ4 740 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dclre1bQ8C7W7 541 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Peg12Q9WVA7 283 aa15.02□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rgs22G3UYX5 1258 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gna14P30677 355 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rufy4Q3TYX8 563 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc17a8Q8BFU8 601 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem87aQ8BXN9 555 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Galnt15Q9D2N8 638 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem2Q5FWI3 1383 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21962L7N280 338 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CflarO35732 481 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klc1O88447 541 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eno1P17182 434 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gucy2eP52785 1108 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kiaa1468Q148V7 1216 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chmp2bQ8BJF9 213 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Heatr3Q8BQM4 679 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zkscan8Q8BSL0 588 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serpinb6cW4VSP4 379 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcna3P16390 528 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ric8aQ3TIR3 530 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SrlQ7TQ48 910 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 IarsQ8BU30 1262 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pnma3Q8JZW8 466 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc65Q8VHI7 493 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 St13Q99L47 371 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kif23E9Q5G3 953 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hace1Q3U0D9 909 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdp2Q504M2 532 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf697Q569E7 569 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lyve1Q8BHC0 318 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gprasp2Q8BUY8 826 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Batf3Q9D275 118 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PudpQ9D5U5 234 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdzd9Q9D9M4 266 aa15.01□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ugt1a5B2RT14 529 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 IkbkbO88351 757 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnajc6Q80TZ3 938 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc103Q9D9P2 237 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 P2rx7Q9Z1M0 595 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Surf1P09925 306 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serpina1eQ00898 413 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 DSCC1Q14AI0 399 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Syne3Q4FZC9 975 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tut1Q8R3F9 869 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt5Q922U2 580 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Aox4Q3TYQ9 1336 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 LtkP08923 888 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pms2P54279 859 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CpQ61147 1061 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Med21Q9CQ39 144 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cst12Q9DAN8 128 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 FscbA1EGX6 1074 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc4a1P04919 929 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Iqsec3Q3TES0 1195 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Acad11Q80XL6 779 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ehd2Q8BH64 543 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ttc14Q9CSP9 761 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pfdn1Q9CWM4 122 aa15□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa14.99□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TnrQ8BYI9 1358 aa14.99□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MycnP03966 462 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Il7P10168 154 aa14.99□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa14.99□□□□□ -0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gngt2Q61017 69 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms