Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Batf3Q9D275 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Batf3Q9D275 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Batf3Q9D275 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Batf3Q9D275 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Batf3Q9D275 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Batf3Q9D275 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Batf3Q9D275 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Batf3Q9D275 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Batf3Q9D275 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Batf3Q9D275 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Batf3Q9D275 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Batf3Q9D275 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Batf3Q9D275 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Batf3Q9D275 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Batf3Q9D275 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Batf3Q9D275 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Batf3Q9D275 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Batf3Q9D275 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Batf3Q9D275 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Batf3Q9D275 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Batf3Q9D275 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Batf3Q9D275 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Batf3Q9D275 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Batf3Q9D275 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Batf3Q9D275 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Batf3Q9D275 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Batf3Q9D275 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Batf3Q9D275 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Batf3Q9D275 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Batf3Q9D275 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Batf3Q9D275 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Batf3Q9D275 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Batf3Q9D275 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Batf3Q9D275 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Batf3Q9D275 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Batf3Q9D275 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Batf3Q9D275 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Batf3Q9D275 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Batf3Q9D275 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Batf3Q9D275 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Batf3Q9D275 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Batf3Q9D275 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Batf3Q9D275 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Batf3Q9D275 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Batf3Q9D275 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Batf3Q9D275 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Batf3Q9D275 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Batf3Q9D275 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Batf3Q9D275 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Batf3Q9D275 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Batf3Q9D275 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Batf3Q9D275 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Batf3Q9D275 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Batf3Q9D275 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Batf3Q9D275 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Batf3Q9D275 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Batf3Q9D275 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Batf3Q9D275 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Batf3Q9D275 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Batf3Q9D275 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Batf3Q9D275 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Batf3Q9D275 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Batf3Q9D275 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Batf3Q9D275 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Batf3Q9D275 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Batf3Q9D275 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Batf3Q9D275 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Batf3Q9D275 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Batf3Q9D275 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Batf3Q9D275 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Batf3Q9D275 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Batf3Q9D275 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Batf3Q9D275 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Batf3Q9D275 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Batf3Q9D275 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Batf3Q9D275 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Batf3Q9D275 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Batf3Q9D275 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Batf3Q9D275 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Batf3Q9D275 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Batf3Q9D275 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Batf3Q9D275 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Batf3Q9D275 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Batf3Q9D275 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Batf3Q9D275 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Batf3Q9D275 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Batf3Q9D275 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Batf3Q9D275 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Batf3Q9D275 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Batf3Q9D275 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Batf3Q9D275 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Batf3Q9D275 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Batf3Q9D275 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Batf3Q9D275 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Batf3Q9D275 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Batf3Q9D275 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Batf3Q9D275 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Batf3Q9D275 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Batf3Q9D275 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms