RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEIP0CG38 1075 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEJP0CG39 1038 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP1BP68106 108 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA3FQ13275 785 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 HYIQ5T013 277 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TREML2Q5T2D2 321 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 LBX2Q6XYB7 198 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 LUZP1Q86V48 1076 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 OTUD5Q96G74 571 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF146Q9NTX7 359 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 COL20A1Q9P218 1284 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 STK24Q9Y6E0 443 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087WWV3 80 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MSH4O15457 936 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCG1P19174 1290 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF76P36508 570 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 AFMP43652 599 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 GRB10Q13322 594 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT79Q5XKE5 535 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MB21D1Q8N884 522 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA5Q96PV4 448 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 STK17AQ9UEE5 414 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPK3Q9Y572 518 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 UTRNP46939 3433 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP6P22004 513 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 MOGSQ13724 837 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 MLKLQ8NB16 471 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RRAGCQ9HB90 399 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEMA6NI47 508 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 MEIS1O00470 390 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP55Q53EZ4 464 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC15Q8TF66 581 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 OPTNQ96CV9 577 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 BCRP11274 1271 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 STAT3P40763 770 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC5A5Q92911 643 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAF5O00463 557 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 IKBKBO14920 756 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CHST13Q8NET6 341 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 DACH1Q9UI36 760 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 VAV3Q9UKW4 847 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CUL4BQ13620 913 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 GJA10Q969M2 543 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 ACAD9Q9H845 621 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RMND1Q9NWS8 449 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 SMTNL1A8MU46 457 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 GJA5P36382 358 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 AMPD3Q01432 767 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.694e-8■■■□□ 15.1
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CAPNS1-207ENST00000589146 ISM2Q6H9L7 571 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 PLIN2Q99541 437 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-207ENST00000589146 BECN2A8MW95 431 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD10O75832 226 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP1P29466 404 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAPC2Q13487 334 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SARM1Q6SZW1 724 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.57■■□□□ 1.68
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